Das FZB erforscht chronisch entzündliche Erkrankungen infektiösen und nicht-infektiösen Ursprungs vor allem der Lunge.

Ein besonderer Fokus der Infektionsforschung am FZB liegt auf der Tuberkulose (TB) als immer noch wichtigster bakterieller Infektion des Menschen und ihrem Erreger, dem Tuberkelbazillus Mycobacterium tuberculosis (Mtb). Die Bedeutung der Tuberkulose-Forschung am FZB ist insbesondere vor dem Hintergrund der steigenden Inzidenz multiresistenter und extrem resistenter M. tuberculosis-Stämme in Zuwanderungsländern hochaktuell.

Im Zuge der Etablierung des Deutschen Zentrums für Infektionsforschung hat das FZB das „Tuberculosis Center Borstel“  etabliert, das die Forschungsaktivitäten im Bereich der Molekularen Epidemiologie, der Populationsbiologie und molekularen Pathogenese klinischer Mtb-Isolate, der Strukturbiologie, zelluläre Mikrobiologie, Infektionsimmunologie und experimentellen anti-infektiven Therapie sowie der klinischen Diagnostik, Therapie und Prävention der Tuberkulose bündelt und strategisch besonders zur Bekämpfung der MDR/XDR-Tuberkulose ausrichtet.

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